抵御抗生素耐药性意味着临床医生们需要小型工具来鉴别出哪种感染是细菌性的，以及引发感染的细菌种类，同时还要揭示出这些细菌对于多种抗生素是否是敏感性的。近日，Illumina公司和生物梅里埃公司（bioMerieux）就通过联合研究推出了一项全基因组测序服务，目的在于改善医源性感染的控制和流行病学的监测。
该服务被称之为EpiSeq，其可以帮助阐明细菌的特性，来帮助医院更好地理解和细菌毒力及耐药性相关的遗传标志物，同时还可以帮助阐明细菌如何传染，对于后期进行流行病学的监测或提供一定的帮助；测序就可以帮助建立不同传染源特性之间的关联，以便可以确定菌株传播的大事件同时便于对其进行监测。
Illumina公司CEO Jay Flatley表示，我们很高兴可以同生物梅里埃合作来提供最前沿的研究，新一代的基因组测序技术可以帮助我们在全基因组的基础上对引发感染性疾病的细菌进行特性分析，而随着抗生素耐药性细菌的不断增多，当前的技术或许并不能及时地为公众健康保驾护航。利用这种新型服务，医院就可以将相关的细菌分离毒株传输至生物梅里埃公司装配有Illumina公司MiSeq测序仪的实验室进行分析，随后的测序数据将会被储存至一种安全的云平台中，这些数据同时还会通过生物梅里埃公司的数据库和软件进行分析，最终的结果会阐明感染性病原体的基因组特性以及相关的遗传突变体。
这项服务是两家公司从2014年11月份开展微生物测序应用的以来的首个服务类型，其将会首先在欧洲推广，其次是北美和亚洲；最开始的服务目录中包括对金黄色葡萄球菌的测序服务，随后将会扩大至和人类机体细菌性感染的多个细菌菌株。
生物梅里埃公司的主席Jean-Luc Belingard说道，我们非常高兴可以成为在细菌流行病学领域向消费者提供创新性测序解决方案的首个公司，目前公司的EpiSeq服务可以帮助解决主要的公众健康挑战，帮助抵御感染性疾病及抗生素耐药性的发生。EpiSeq服务的发起或将为后期同Illumina公司进行更深入的合作来讲新一代测序技术应用于细菌基因组测序奠定坚实的基础。
