HPV疫苗的问世为预防宫颈癌和生殖器疣等疾病提供了新的有效途径，不过关于它的争议也从未平息。除了安全性和有效性之外，HPV疫苗是否会对青少年性行为造成影响也是不少人关心的焦点。一些人认为，推广HPV疫苗会助长青少年不安全的性行为，并造成更多的性传播疾病风险。而最近发表在《美国医学会期刊•内科学》（JAMA Internal Medicine）上的研究则显示，HPV疫苗与这样的风险并不存在关联。
在美国，将近一半的14~19岁女性和45%的20~24岁女性感染HPV，而HPV疫苗可以预防因HPV感染而导致的宫颈癌、阴道癌变以及生殖器疣。但目前在美国，HPV疫苗的接种率仍然较低。到2013年时，有57%的13~17岁女性接受了一次或一次以上接种，而完成了全部三次接种的只有38%。
来自哈佛大学的阿努潘•耶拿博士（Anupam B. Jena）和他的同事们认为，“HPV疫苗促进不安全性行为”的想法可能是阻碍其推广的一个因素，因此，他们通过保险数据库收集了大量青少年女性数据对这一问题进行了分析。
研究者们收集了2005年至2010年12~18岁青少年女性的数据。研究中共纳入了21610名接受HPV疫苗接种的青少年女性，分别分析她们在接种前后的性活跃程度和性传播疾病患病率，并以186501名未接种疫苗女性的数据作为对照，进行了倍差法（difference in difference）分析。该研究纳入的性传播疾病包括衣原体感染、淋病、生殖器疱疹、HIV感染以及梅毒。
在2006年年末时，只有2.5%的受试女性接受HPV疫苗接种，而在2010年末这个数字增加到了27.3%。分析结果显示，接种HPV疫苗的女性群体中性传播疾病的发生率会比未接种疫苗的对照人群高一些，且两组人群中发病率都随着时间推移有所上升，但是HPV疫苗接种并不是与发病率上升相关的因素。接种疫苗的女性在接种前一年的性传播疾病发病率为千分之4.3，同时期对照组女性的发病率为千分之2.8。而在接种疫苗之后的一年，接种疫苗的女性当中性传播疾病发病率为千分之6.8，对照人群的发病率也增长到千分之4.2。研究者分别计算了两个时间点上两组发病率的比值，结果发现，无论进行总体分析还是按年龄分组，这个发病率比值都不会随着HPV疫苗的接种而发生显著改变，由此提示HPV疫苗与性传播疾病风险之间并未发现相关性。
在研究论文中，作者得出了以下结论：“没有证据表明HPV疫苗会导致性传播疾病感染率增加。我们的研究结果可以使医生、家长和政策制定者们放心，HPV疫苗看起来不太可能会增加不安全性行为的风险。”
在一篇相关评论文章中，埃默里大学的罗伯特•贝德纳尔奇克（Robert A.Bednarczyk）博士写到：“部分家长和医生对为少女接种HPV疫苗犹豫不决，其中的一个原因就是担心疫苗成为了对‘乱搞’的默许。而这次的研究又为我们提供了新的分析数据，显示没有证据表明HPV疫苗接种会导致不安全性行为的增加。”
“对于这个领域的研究者来说，这一发现并不让人感到意外，它继此前的研究之后又为我们提供了更多‘HPV疫苗不会导致性行为失控’的保证。不过，这也为我们留下了另一个问题：我们如何把这些发现传达给忧虑的家长们？对于推进HPV疫苗的阻碍因素已经有了不少研究，但减少这些阻碍的具体措施还有待进一步研究。”
