Caliper微流体芯片技术成为评估基因组DNA质量的新方法

2013-03-15 08:00 · johnson

在基因组DNA质量评估方面,LabChip GX仪器借助Lab on Chip技术实现了测序的高度重复性和通用性,从而克服了依赖于凝胶方法的局限,这一应用会随着疾病和药物治疗在遗传水平上的研究变得愈发突出。

随着疾病和药物治疗在遗传水平上的研究越来越普遍,高质量基因组DNA的有效性及评估其质量的方法是必不可少的。在一些研究中,比如下一代测序和分子诊断,保证基因组DNA的完整性(有大片段的分布并没有降解)是得到高质量结果的决定性步骤。

Caliper微流体芯片工作示意图

目前,琼脂糖凝胶通常被用于直观的分析基因组DNA的质量。这些凝胶是可以提供信息的,但是也同样存在差异性,如大小、smearing、定量和染色(尤其在加入量不同时)等。另外,以胶为基础的实验很难实现自动化,或者难于分析大量的样品,也不能提供真实的分布情况和得到数字化的数据结果。

Caliper公司研发的微流体芯片称为Lab on Chip,把生物和化学等领域中所涉及的样品制备、反应、分离、检测等基本操作单元集成或基本集成到一块微小尺寸的芯片上,由微通道形成网络,以可控流体贯穿整个系统。

Lab on Chip技术主要是使用LabChip GX仪器(一个高通量,自动化的微流体芯片电泳分离平台)来评价基因组DNA的质量。这个分析产生了一个质量参数标准- 基因组DNA质量分数the gDNA Quality Score (GQS)-以确定一个样本可以进行后续分析的可接受的标准。基因组DNA质量分数(GQS)范围从0到5,分数为5表现为最高质量。由LabChip GX仪器带来的高度重复性、通用性和高通量克服了依赖于凝胶方法的局限。而且,数据结果是数字化的,更方便于存档和发布。

LabChip GX仪器预充芯片,并自动化的得到样本的电泳分析结果。样本逐个由毛细管自动化的吸取,当样本进入到芯片中,样本在微流体芯片管路中被染色,分离和检测。

在基因组质量评估上可改进医疗服务的微流体芯片

微流体芯片的研究始于上世纪90年代,此后,陆续得到了各国政府的重视和支持。十多年来,微流体芯片已经出现了一大批基础性研究成果。微流体芯片在世界范围属于分析技术的前沿,其所具有的优势和潜在影响已被学术界认可,并且被越来越多的产业界人士接受。

目前,包括分析化学科研界以及临床诊断和科学仪器产业界已经达成共识,微流体将成为下一带分析平台的基本技术,而一些国外公司已经陆续推出基于微流体理念的原型产品。微流体技术有可能引发分析技术领域思想的转变,推动分析仪器的微型化自动化并实现快速高效的分析工作。

国外已出现一批以微流体芯片为主要业务的企业,目前仍以小型的为主,也有个别的已发展到相当的规模,如美国的Caliper公司,另有一些大公司逐步把微流体芯片视为其主要业务领域之一,比如Agilent和Motorola。目前以诊断产品为主的企业还不多,但申请的专利有逐年上升的趋势。

作为下一代分析产品的主流技术,微流体产品具有广阔的发展空间,尤其是在疾病诊断领域。由于微流体产品在微型化、集成化和低消耗等方面的优势,将有益于医疗诊断产品的推广和医疗成本的降低,从而实现医疗条件的改善。