7月14日,北京蛋白质组中心朱云平教授作了《人类肝脏蛋白质组的数据管理和分析》(Data Management and Analysis of Human Liver Proteome)的精彩演讲,朱教授在演讲中重点介绍了凤凰工程项目的远大目标、基于项目的生物信息学平台的架构以及为生物信息学带来的革命性影响。
朱教授从“蛋白质组生物信息学所面临的挑战”开始,以HUPO测试样品的研究揭示质谱为基础的蛋白质组学的常见问题,针对数据爆炸的情况,他认为新的数学工具和更复杂的计算方法是解决这样困境的出路。
朱云平教授:凤凰工程——打造中国最大的蛋白质组学研究设施
针对肽鉴定的质量控制问题,朱教授指出在数据分析过程中,构建了多种质谱数据搜索的SOPs,从而有效实现了多来源、海量复杂实验数据的分析、整合;系统建立质谱蛋白质鉴定的质量控制体系,为蛋白质组装提供更完备的可信肽段列表,为后续生物学问题的研究提供了完整可靠的数据;在标准蛋白数据集上应用新搜索策略,提高了肽段质量控制方法的灵敏性。之后,朱教授又从数据库和数据挖掘、蛋白质表征、数据库与数据挖掘方法等方面,结合目前生物信息学所面临的问题与结症,提出了相应的应对措施。
朱云平教授最后简要的介绍了国家蛋白质科学基础设施——凤凰工程项目的情况,凤凰工程旨在打造中国的最大的蛋白质组学研究设施,实现建立大型的蛋白质组学研究能力、发现驱动的研究探索商业模式、生产高品质的蛋白质组学数据与世界分享、为了开发新的蛋白质组学下一代仪器和方法等目标。朱教授指出,凤凰工程所要打造的生物信息学平台以整合数据为基础,其中包括实验、外围的数据,在此基础上,建立分析平台,实现对外共享原始数据和分析结果。之后,他介绍了凤凰工程项目所能达到的运算速度、存储量以及互联网速度,引起了与会嘉宾的浓厚兴趣。“凤凰工程”项目的建设将进一步提升我国蛋白质科学的整体研究水平和能力,培养高水平人才,为我国生命科学研究和发展做出重要贡献。
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