为贯彻落实国务院有关会议和水污染治理专项领导小组专题会议精神，强化地方政府参与水污染治理专项的管理实施，统一思想形成合力，推进水污染治理专项太湖流域工作，2011年4月26日，水污染治理专项牵头组织部门环境保护部、住房城乡建设部会同江苏省、浙江省和上海市水污染治理专项协调领导小组办公室在南京组织召开了水污染治理专项太湖流域协调工作会议。国家水污染治理专项管理办公室，科技部重大专项办公室，环境保护部监察局、污防司，水利部太湖流域管理局，江苏省、浙江省和上海市水污染治理专项协调领导小组办公室负责同志，太湖流域有关地（市）水污染治理专项办公室负责同志，水污染治理专项总体专家组、主题专家组和太湖流域有关专家，有关项目（课题）技术支持单位代表100余人参加了会议。
会议传达了国务院重大专项实施推进会、三部门综合平衡会、水污染治理专项领导小组专题会议精神，听取了湖泊、城市、饮用水、监控预警、战略与政策五个主题负责人关于“十一五”太湖流域研究进展和“十二五”太湖流域研究任务设置的介绍，太湖流域相关专家和地方水污染治理专项负责同志对“十二五”太湖流域任务设置进行了讨论。会议提出了进一步明确水污染治理专项与太湖综合治理方案的关系、做好流域集成与主题研究的衔接、任务设置向综合示范区集中、形成整装成套技术体系和标志性成果、尽快组建太湖流域专家组等建议。
会议强调，“十二五”期间太湖流域各方面力量要统一思想、凝聚共识，认真按照党中央、国务院和水污染治理专项领导小组的最新要求，充分依靠地方人民政府，建立健全流域和主题矩阵式管理模式，以只争朝夕的精神共同推进水污染治理专项各项工作。
