各国精准医疗进展:国际基因产业大会专场报告精华

2016-11-07 06:00 · 文姜

第七届国际基因产业大会于2016年11月3-5日在上海外高桥喜来登酒店召开。从11月3日下午到4日和5日,国际基因产业大会以不同议题组织分会场进行学术报告和交流讨论。今天小编就给您分享一下大会的基因组药物和个性化医疗当前趋势的专场报告,聊一聊在精准医疗方面各国都做的怎么样了。


第七届国际基因产业大会于2016年11月3-5日在上海外高桥喜来登酒店召开。此次会议邀请了自世界40多个国家和地区在基因领域最具影响力的世界著名大学与研究机构的专家,世界各大基因产业公司高管、资深科学家和项目组长。

从11月3日下午到4日和5日,国际基因产业大会以DNA和RNA的研究,基因组学和遗传学的进步,生命科学的前沿研究,医学应用的新兴领域,生物催化和生物工艺,强大的技术开发和应用的基因技术在农业和食品领域等不同议题组织分会场进行学术报告和交流讨论。今天小编就给您分享一下大会的基因组药物和个性化医疗当前趋势的专场报告,聊一聊在精准医疗方面各国都做的怎么样了。

1

梅奥医学中心Richard Weinshilboum教授报告


已在开幕式做过大会特邀嘉宾报告的美国临床药理学委员会提名委员会主席,美国著名梅奥医学中心的教授Richard Weinshilboum医生在这个专题内又做了报告,介绍了梅奥中心在个性化医疗方面所做的工作。在个性化医疗的研究范畴,梅奥医学中心除了前面提到的药物基因组学,在进行中的计划还包括生物标志物的发现、临床多组学研究、表观基因组学和微生物菌群基因组学。梅奥的药物基因组学和精准医疗研究由NIH的药物基因组研究网络(PGRN)基金和eMERGE基金支持。

他详细介绍了前面提到的梅奥 RIGHT 10K 计划,这个计划将在梅奥的患者中分析上万人的药物基因组,将数据结合电子医疗记录进行分析。在梅奥患者的1万人生物数据库中抽取77名进行二代基因测序,将电子医疗记录溯源至20年前,医疗记录警示了存在19对药物和基因的配对。计划的研究既运用医疗记录进行回顾性分析,来避免由于药物基因型的存在造成的药物无效的作用;也用基因与药物的数据分析进行预测研究避免缺乏药效的分析。

在癌症基因组分析方面的研究,他们既进行生殖细胞基因组分析也进行癌症体细胞基因组分析,该项研究称为Germline-Somatic Genome PGx Cross-Talk。Richard Weinshilboum医生举了他们在乳腺癌方面进行精准医疗的例子,研究项目开展之前,乳腺癌在梅奥就是按基因型来内分泌疗法和化疗的。新的项目在乳腺癌HER2+中的诊断、药物治疗和手术中每一步都综合影像、生物分析和基因组测序。这个治疗叫做乳腺癌基因组介导的治疗,缩写为BEAUTY。从2012年对第一个病人实施,2014年增加为140名,现在已经进入了第二期,对所有的乳腺癌病人都根据DNA进行个性化治疗。

2
梅奥医学中心 Liewei Wang教授报告


梅奥医学中心 Liewei Wang教授则详细介绍了在他们在BEAUTY计划中,将人源性肿瘤组织异种移植模型运用在乳腺癌药物基因组中的研究与治疗。之所以要用活检组织和病人样本制备人源性肿瘤组织异种移植模型,是由于患者对于化疗的反应很不一致,治疗也没有明显的生物标志物。

传统的模式是对肿瘤手术后化疗观察,而新的辅助疗法是对肿瘤活检取样后移植到小鼠,然后对模型进行组织化学和微芯片分析,进行药物基因组学的外显子、RNA、表观基因组和蛋白组的多组学分析,根据这些结果进行药物筛选。再根据化疗药物处理的结果来进行手术和用药。新的辅助疗法允许在短时间内研究药物的反应,获得不同基因组的化疗结果,并构建体内模型。这个模型允许对于药物抗性的肿瘤检测不同的疗法的作用,并研究不同患者间遗传改变后的功能变化。此模型运用在高风险的乳腺癌病人里获得了长期的生存。

她总结说药物基因组模型将会很快地发展并成为预临床药物研发的标准工具。整合的多组学也将帮助我们理解药物抗性的机制,加快药物的研发。

3
加拿大阿尔伯特大学Katherine J Aitchison教授报告


来自于加拿大阿尔伯特大学Katherine J Aitchison教授介绍了基因组学在临床上的应用。她一CYP2D6基因为例介绍了他们在药物基因组上的工作。CYP2D6是最广泛被描述的药物代谢多组学的酶,有20-25%的药物由这个酶代谢,对于临床用药非常重要。有些药物和抗生素往往由CYP2D6代谢或者是它的抑制剂,或两者都是。而CYP2D6的分布在个体间有很大差异。

Katherine J Aitchison教授介绍CYP2D6有四种不同的基因型:UM,EM,IM和PM,它们的分布在不同种族中是不相同的。已经发现了100种以上的等位基因。根据他们的研究CYP2D6可能的临床测试平台使用Affymetrix的芯片。在这三种基因型中安定药的使用可以区分出不同的剂量,让精神疾病的治疗更加有效。

4
加拿大麦克马斯特大学Judah A. Benburg教授报告


加拿大麦克马斯特大学Judah A. Benburg教授则介绍了过敏和哮喘方面的精准治疗和生物标志物的研究。AllerGen研究过敏、基因和环境的关系,由1989年开始的加拿大杰出中心网络计划所支持,旨在产生一个持久的机制来减轻过敏和其它相关疾病的影响。到2019年的AllerGen包含三个部分:加拿大新生儿长期发育研究,临床调查的合作以及国家食物过敏研究方案。将对过敏相关的生物标志物和生物信息学,基因-环境的作用以及病人、政策和公共卫生进行研究。

关于项目的进展情况,Judah A. Benburg教授介绍了他们在加拿大新生儿长期发育研究计划中,调查了出生百日内减少过敏风险的细菌。这是第一篇将微生物菌群和过敏联系起来的研究文章,能够鉴定有过敏风险的孩童并进行治疗。在这个计划的范畴中他们还调查了户外空气污染的影响,鉴定了对已有环境的精准评估并筛选出能作为生物标志物的肠道菌。

其中AirSENCE个人空气暴露过敏原分析计划是与北京大学合作的,由两国间的研究计划和企业合作伙伴提供支持。此项目能够提供对户外或户内污染的个人评估和管理。